More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0023 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0023  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 131 aa  274  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  58.46 
 
 		 133 aa  164  2.9999999999999998e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  53.49 
 
 		 132 aa  160  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  51.91 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  52.67 
 
 		 132 aa  157  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  51.97 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  53.54 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  51.16 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  52.34 
 
 		 130 aa  147  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  56 
 
 		 133 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  51.59 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  49.19 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  52.42 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  54.62 
 
 		 131 aa  141  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  54.03 
 
 		 133 aa  140  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  48.39 
 
 		 143 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  47.24 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  50.39 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  49.61 
 
 		 129 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  51.88 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  48.39 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  49.21 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  43.31 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.279914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  43.41 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  49.21 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  41.73 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  46.51 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  44.8 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  40.94 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1494  hypothetical protein  49.61 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  44.96 
 
 		 134 aa  132  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  45.04 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  51.22 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  44.19 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  47.29 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  49.21 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1521  protein of unknown function UPF0047  44.88 
 
 		 133 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  43.41 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  48.78 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  48.39 
 
 		 132 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  45.97 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  47.06 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  47.5 
 
 		 133 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  46.92 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  43.31 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  47.46 
 
 		 132 aa  120  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  42.06 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  45.45 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2645  protein of unknown function UPF0047  41.73 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  46.15 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1222  protein of unknown function UPF0047  46.51 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545275 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  45.16 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0970  hypothetical protein  45.74 
 
 		 136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0551  hypothetical protein  39.68 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0534  hypothetical protein  39.68 
 
 		 135 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  47.58 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  40.6 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  42.74 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  40.6 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  40.6 
 
 		 160 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  41.46 
 
 		 143 aa  96.7  9e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  40.32 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  40.34 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  38.52 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  36.89 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  42.5 
 
 		 157 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  39.37 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  40.48 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  37.3 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  42.5 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.69 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 		 138 aa  89.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  37.88 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  37.12 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  32.31 
 
 		 138 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  37.1 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  36.64 
 
 		 138 aa  88.2  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0528  protein of unknown function UPF0047  32.85 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  87.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  43.69 
 
 		 157 aa  87  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2784  hypothetical protein  51.72 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00159172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  41.67 
 
 		 160 aa  87  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  36.36 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  34.96 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  35.11 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  43.69 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  34.85 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  40.15 
 
 		 160 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  39.39 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  32.82 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  35.61 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  37.3 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  35.43 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  39.2 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  33.59 
 
 		 138 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>