More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1952 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 139 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  52.9 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  49.64 
 
 		 161 aa  135  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  48.15 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  49.63 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  46.46 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  43.7 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  46.72 
 
 		 138 aa  122  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  46.32 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  42.22 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  39.86 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  42.65 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  43.2 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  42.86 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  38.64 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  36.97 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  39.06 
 
 		 143 aa  84.3  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  38.64 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  36.51 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  38.64 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  42.75 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  36.51 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  37.68 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  38.76 
 
 		 133 aa  81.6  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  34.92 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  37.19 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  30.43 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1293  hypothetical protein  36.81 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  37.12 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  32.79 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  36.23 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1880  hypothetical protein  36.96 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  38.58 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  32.58 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  34.78 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  38.06 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  34.35 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  34.53 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  31.91 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  34.04 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  32.12 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  34.62 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  37.59 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  38.28 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40920  predicted protein  35.77 
 
 		 184 aa  75.1  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  33.1 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  31.39 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  37.23 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  31.3 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  34.04 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  34.85 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  33.79 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  32.61 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  31.09 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  39.2 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  34.68 
 
 		 136 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  32.61 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  30.77 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  30.25 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  38.4 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  31.67 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  31.3 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  32.5 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  37.6 
 
 		 160 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  32.12 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  35.48 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  33.59 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  29.77 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  29.06 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2137  hypothetical protein  34.06 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.435583  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  37.82 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3660  protein of unknown function UPF0047  35 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  30.5 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  31.16 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  29.41 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2384  hypothetical protein  34.71 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  30.71 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  31.67 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2217  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.851507  hitchhiker  0.001424 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  30.25 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1893  hypothetical protein  34.86 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.323991 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  31.01 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1216  hypothetical protein  39.67 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.372222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  35.48 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  28.28 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  33.6 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  30.22 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  36.13 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3428  protein of unknown function UPF0047  32.86 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  36.13 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  34.78 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  31.39 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  31.91 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  36.13 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2676  protein of unknown function UPF0047  32.86 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>