261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2392 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  262  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  262  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  262  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  85.83 
 
 
129 aa  225  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  82.68 
 
 
129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  77.61 
 
 
136 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  62.6 
 
 
133 aa  164  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  66.1 
 
 
134 aa  157  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  62.71 
 
 
140 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  61.48 
 
 
135 aa  152  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  64.62 
 
 
135 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  58.33 
 
 
155 aa  149  8.999999999999999e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  72.28 
 
 
135 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  57.58 
 
 
151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  55.64 
 
 
142 aa  144  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  56.82 
 
 
134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  49.24 
 
 
136 aa  140  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  61.94 
 
 
136 aa  140  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  65.35 
 
 
129 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  53.6 
 
 
157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  62.12 
 
 
134 aa  135  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  66.94 
 
 
133 aa  133  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  56.39 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  57.89 
 
 
135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  36.51 
 
 
132 aa  84.3  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  36.36 
 
 
129 aa  82.8  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  37.3 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  37.96 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  34.4 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  40.65 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  35.45 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  38.21 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  43.09 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  35.11 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  36.28 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  29.85 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  34.07 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  38.76 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  35.94 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  33.82 
 
 
161 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  31.3 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  35.2 
 
 
140 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  34.17 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  43.36 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  32.81 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  35.83 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  34.4 
 
 
141 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  35.56 
 
 
131 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  39.42 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  36.13 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  34.38 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  35.04 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  41.73 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  33.08 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  34.88 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  33.88 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  33.05 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  42.52 
 
 
139 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  34.38 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  29.91 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  40.94 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  32.03 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  34.13 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  35.77 
 
 
130 aa  67.8  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  34.59 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  35.66 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  34.48 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  31.71 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  35.77 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  33.08 
 
 
142 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  33.08 
 
 
137 aa  67  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  41.53 
 
 
126 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  28.12 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  34.59 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.07 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  33.83 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  28.45 
 
 
132 aa  64.3  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3301  hypothetical protein  32.82 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0121064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3433  protein of unknown function UPF0047  31.54 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  38.46 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36.29 
 
 
132 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  27.56 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  32.06 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  32.06 
 
 
143 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  35.59 
 
 
131 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3175  hypothetical protein  32.09 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5144  hypothetical protein  32.06 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.356001  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  32.03 
 
 
131 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  28.21 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1335  hypothetical protein  32.06 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970106  decreased coverage  0.00476745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2118  protein of unknown function UPF0047  33.08 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  30.97 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  30.77 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4149  hypothetical protein  32.56 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.183368  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4801  hypothetical protein  32.56 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.639835  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2316  protein of unknown function UPF0047  32.82 
 
 
138 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>