258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0539 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 157 aa  307  2.9999999999999997e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  57.03 
 
 		 133 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  49.24 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  53.03 
 
 		 151 aa  142  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  52.27 
 
 		 134 aa  140  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  54.24 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  53.6 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  53.6 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  53.6 
 
 		 129 aa  138  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  53.6 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  55.81 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  50.77 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  51.16 
 
 		 142 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  51.15 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  50.43 
 
 		 140 aa  131  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  49.63 
 
 		 135 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  50 
 
 		 129 aa  124  3e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  53.6 
 
 		 129 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  50.75 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  51.11 
 
 		 136 aa  124  7e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  51.13 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  50.75 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  45.19 
 
 		 136 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  50.41 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  35.04 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  35.56 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  30.88 
 
 		 143 aa  71.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  29.51 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  35.25 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  30.4 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  34.85 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  39.13 
 
 		 138 aa  66.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  29.71 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  31.03 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4820  hypothetical protein  31.97 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.277818  normal  0.824892 
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.62 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  27.41 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0918  protein of unknown function UPF0047  34.51 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.676321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1451  hypothetical protein  34.17 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  29.1 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  35.48 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1088  protein of unknown function UPF0047  29.41 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.977912 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  26.28 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  32.37 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1995  hypothetical protein  30.23 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  32.77 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2258  hypothetical protein  33.06 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.479021 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  29.01 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  30.47 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  24.82 
 
 		 132 aa  57  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  38.21 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  34.13 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3690  hypothetical protein  32.48 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  34.4 
 
 		 128 aa  57  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3472  protein of unknown function UPF0047  27.34 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00822222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4567  hypothetical protein  33.04 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0834  hypothetical protein  31.86 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0564298 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  27.27 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  33.09 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  30.08 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  27.74 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  28.47 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  33.06 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0889  protein of unknown function UPF0047  32.04 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0742  conserved hypothetical protein TIGR00149  32.04 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2505  protein of unknown function UPF0047  33.33 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2911  hypothetical protein  30.63 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735439  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3696  hypothetical protein  28.18 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  28.93 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  32.48 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  30.77 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1703  protein of unknown function UPF0047  28.46 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  31.13 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3562  protein of unknown function UPF0047  33.05 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  26.02 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3000  protein of unknown function UPF0047  28.79 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  30.33 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2190  hypothetical protein  26.52 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  30.7 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  30.47 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  25 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  24.44 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2820  hypothetical protein  28.79 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269441  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  31.62 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3238  hypothetical protein  32.2 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  29.91 
 
 		 141 aa  53.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2407  hypothetical protein  30.6 
 
 		 137 aa  53.1  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0643  protein of unknown function UPF0047  31.86 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  26.28 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0267  hypothetical protein  33.65 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.508397  normal  0.204565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  29.75 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  29.82 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  25.55 
 
 		 132 aa  51.6  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4225  protein of unknown function UPF0047  30.47 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>