233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12577 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12577  hypothetical protein  100 
 
 
129 aa  259  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0908128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2639  hypothetical protein  82.95 
 
 
129 aa  220  7e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2345  hypothetical protein  82.68 
 
 
133 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.202939  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2392  hypothetical protein  82.68 
 
 
133 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2386  hypothetical protein  82.68 
 
 
133 aa  218  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3764  hypothetical protein  73.28 
 
 
136 aa  201  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1034  hypothetical protein  61.72 
 
 
133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0183321 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3395  hypothetical protein  64.1 
 
 
140 aa  152  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1363  protein of unknown function UPF0047  64.71 
 
 
134 aa  150  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2358  hypothetical protein  59.69 
 
 
135 aa  147  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0335235  normal  0.0190831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7042  protein of unknown function UPF0047  56.8 
 
 
135 aa  141  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22490  conserved hypothetical protein TIGR00149  58.82 
 
 
155 aa  141  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.282378  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10190  conserved hypothetical protein TIGR00149  61.07 
 
 
136 aa  140  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.698161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3612  hypothetical protein  55.28 
 
 
134 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1966  hypothetical protein  56.78 
 
 
142 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.387815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1646  protein of unknown function UPF0047  64.08 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3372  hypothetical protein  54.47 
 
 
151 aa  135  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1861  hypothetical protein  59.69 
 
 
129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0103013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2945  protein of unknown function UPF0047  63.87 
 
 
135 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142491  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2870  hypothetical protein  64.17 
 
 
133 aa  131  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3056  hypothetical protein  59.69 
 
 
134 aa  130  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0880  protein of unknown function UPF0047  49.57 
 
 
136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0539  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 
157 aa  124  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.503059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5843  protein of unknown function UPF0047  58.33 
 
 
135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.228828  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  38.28 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  39.06 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  36.57 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  43.2 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1631  hypothetical protein  37.59 
 
 
138 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.482236  normal  0.0285677 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0951  hypothetical protein  36.09 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.672358  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1527  protein of unknown function UPF0047  34.17 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3540  protein of unknown function UPF0047  40.32 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  33.86 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  36.22 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  36.36 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  33.08 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  33.86 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1711  hypothetical protein  40.18 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1261  protein of unknown function UPF0047  30.65 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.285021  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0408  protein of unknown function UPF0047  44.25 
 
 
128 aa  70.1  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1050  protein of unknown function UPF0047  40.17 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  0.296699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  33.07 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  33.04 
 
 
131 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  36.07 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0349  protein of unknown function UPF0047  34.17 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0772026  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  34.65 
 
 
137 aa  68.9  0.00000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  36.92 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1745  protein of unknown function UPF0047  41.13 
 
 
132 aa  67.8  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  36.59 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  35.96 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0313  hypothetical protein  36.15 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  35.04 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1952  protein of unknown function UPF0047  38.33 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  33.05 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  33.06 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  32.8 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1415  hypothetical protein  39.02 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  36.72 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  30.16 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1517  protein of unknown function UPF0047  33.04 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_136  hypothetical protein  31.67 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1051  protein of unknown function UPF0047  39.83 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108207  normal  0.446861 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  34.96 
 
 
143 aa  63.9  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  31.67 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  35.34 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0129  hypothetical protein  33.33 
 
 
138 aa  62  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00760  hypothetical protein  30.25 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000404598  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  33.61 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  31.4 
 
 
141 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  36.59 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  34.78 
 
 
136 aa  61.6  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2442  hypothetical protein  33.9 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.823465 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1537  hypothetical protein  30.17 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  36 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  32.28 
 
 
148 aa  60.5  0.000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0986  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0759646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  36.21 
 
 
132 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5282  protein of unknown function UPF0047  31.54 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.421624  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2637  protein of unknown function UPF0047  37.74 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00164321  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0983  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2724  hypothetical protein  28.93 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.277726  decreased coverage  0.0000377409 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0927  hypothetical protein  37.98 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  37.14 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  27.83 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  36.08 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5223  hypothetical protein  33.08 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0454  hypothetical protein  28.45 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  33.9 
 
 
141 aa  58.5  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0850  hypothetical protein  34.11 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.719995 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0242  hypothetical protein  30.23 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0382  hypothetical protein  28.45 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.279914 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  32 
 
 
137 aa  56.2  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0621  hypothetical protein  34.75 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.688874  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2889  hypothetical protein  31.06 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0099  hypothetical protein  32.31 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.426584  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2595  protein of unknown function UPF0047  30.83 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0242418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2260  protein of unknown function UPF0047  27.78 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000782775  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0131  hypothetical protein  32.31 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0104  hypothetical protein  32.31 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>