64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3138 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  100 
 
 		 358 aa  688    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  69.38 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  28.33 
 
 		 417 aa  169  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  28.26 
 
 		 423 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  28.16 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  28.39 
 
 		 406 aa  160  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  28.57 
 
 		 410 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  29.82 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  27.03 
 
 		 423 aa  157  3e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  26.96 
 
 		 428 aa  152  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  28.5 
 
 		 417 aa  149  6e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  27.57 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  28.93 
 
 		 384 aa  149  7e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  27.86 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  27.18 
 
 		 413 aa  146  5e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  27.81 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  27.25 
 
 		 385 aa  143  5e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  27.03 
 
 		 414 aa  143  6e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  24.07 
 
 		 435 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  26.91 
 
 		 415 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  28.36 
 
 		 419 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  25.56 
 
 		 415 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  26.89 
 
 		 389 aa  137  4e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  25 
 
 		 439 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  24.57 
 
 		 436 aa  134  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  26.84 
 
 		 357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  25.77 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  23.66 
 
 		 419 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  22.96 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  25.81 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  24.28 
 
 		 419 aa  116  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  24.69 
 
 		 457 aa  116  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  23.65 
 
 		 426 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  21.54 
 
 		 419 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  21.95 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  21.54 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  23.2 
 
 		 348 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  37.3 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  21.81 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  23 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  21.4 
 
 		 348 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  20.74 
 
 		 348 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  27.97 
 
 		 342 aa  52.8  0.000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  21.82 
 
 		 395 aa  50.4  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  25.6 
 
 		 347 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2020  hypothetical protein  32.35 
 
 		 224 aa  49.7  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  26.49 
 
 		 355 aa  49.7  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  33.33 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  26.94 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  28.08 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  34.02 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5973  hypothetical protein  34.23 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342038  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  29.46 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  28.47 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  20.15 
 
 		 369 aa  46.6  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  33.59 
 
 		 341 aa  46.6  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1962  hypothetical protein  35.96 
 
 		 216 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  30.89 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2284  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.030938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0591  hypothetical protein  32.45 
 
 		 317 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2291  hypothetical protein  37.65 
 
 		 363 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  29.61 
 
 		 351 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  33.72 
 
 		 341 aa  43.1  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  36.25 
 
 		 344 aa  42.7  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>