48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1536 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 419 aa  854    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  98.33 
 
 		 419 aa  842    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  75.3 
 
 		 419 aa  646    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  89.98 
 
 		 419 aa  785    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  98.81 
 
 		 419 aa  848    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  47.85 
 
 		 406 aa  397  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  46.17 
 
 		 414 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  45.67 
 
 		 413 aa  373  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  42.79 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  45.45 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  47.07 
 
 		 428 aa  366  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  46.25 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  44.31 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  43.1 
 
 		 423 aa  345  1e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  42.37 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  43.3 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  40.53 
 
 		 419 aa  309  6.999999999999999e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  37.98 
 
 		 417 aa  306  6e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  38.88 
 
 		 416 aa  300  2e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  37.71 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  39.42 
 
 		 419 aa  290  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  35.42 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  40.06 
 
 		 357 aa  229  7e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  39.73 
 
 		 338 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  31.31 
 
 		 435 aa  212  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  30.46 
 
 		 439 aa  203  5e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  30.02 
 
 		 436 aa  202  9e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  29.13 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  28.71 
 
 		 442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  37.74 
 
 		 384 aa  196  5.000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  36.25 
 
 		 385 aa  192  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  35.6 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  34.57 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  30 
 
 		 390 aa  172  7.999999999999999e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  23.41 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  22.93 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  26.83 
 
 		 355 aa  50.4  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  23.79 
 
 		 355 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  25.23 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  28.23 
 
 		 383 aa  46.6  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2745  hypothetical protein  23.53 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2789  hypothetical protein  23.53 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0918  hypothetical protein  29.51 
 
 		 391 aa  45.8  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00435551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2775  hypothetical protein  23.53 
 
 		 366 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365016  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  21.63 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09690  Fe-S oxidoreductase  28.57 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.268372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  22.18 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  22.27 
 
 		 355 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>