48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0882 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 426 aa  872    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  37.02 
 
 		 410 aa  292  7e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  34.98 
 
 		 423 aa  279  9e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  34.75 
 
 		 423 aa  275  9e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  35.21 
 
 		 423 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  35.87 
 
 		 419 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  35.48 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  34.87 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  34.03 
 
 		 428 aa  258  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  33.01 
 
 		 419 aa  257  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  35.66 
 
 		 419 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  34.36 
 
 		 415 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  34.36 
 
 		 417 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  34.2 
 
 		 414 aa  249  8e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  31.21 
 
 		 419 aa  239  6.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  35.82 
 
 		 419 aa  233  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  35.82 
 
 		 419 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  31.99 
 
 		 416 aa  232  9e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  31.12 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  33.33 
 
 		 435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  34.05 
 
 		 442 aa  226  7e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  31.81 
 
 		 415 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  29.91 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  31.44 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  32.31 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  32.13 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  30.66 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  29.21 
 
 		 357 aa  177  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  29.97 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  29.19 
 
 		 385 aa  166  8e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  28.9 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  29.48 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  29.68 
 
 		 390 aa  161  2e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  31.54 
 
 		 338 aa  160  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  23.65 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  21.87 
 
 		 362 aa  108  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  32.78 
 
 		 350 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  26.15 
 
 		 328 aa  59.7  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  25.76 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  22.5 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2532  Peptide chain release factor 1 (eRF1)-like protein  28.37 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.023153  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  33.02 
 
 		 347 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  30.19 
 
 		 351 aa  47  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  26.83 
 
 		 355 aa  47  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  21.3 
 
 		 298 aa  46.6  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  25 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  28.87 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  23.21 
 
 		 348 aa  43.5  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>