38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0109 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  100 
 
 		 349 aa  701    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  28.12 
 
 		 348 aa  129  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  26.59 
 
 		 350 aa  123  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  28.86 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  26.96 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  28.01 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  26.78 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  26.09 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  26.09 
 
 		 348 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  23.63 
 
 		 355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  25.73 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  26.16 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  25.14 
 
 		 355 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  27.56 
 
 		 355 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  27.78 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  27.49 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  26.24 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  26.99 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  27.11 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  25.22 
 
 		 337 aa  99.8  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  25.22 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  27.83 
 
 		 342 aa  97.1  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  23.8 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  24.41 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  23.7 
 
 		 330 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  23.99 
 
 		 341 aa  74.7  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  21.55 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  22.96 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  23.87 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  22.25 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  20.99 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  24.69 
 
 		 385 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  22.22 
 
 		 385 aa  53.5  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  22.5 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  20.57 
 
 		 415 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  23.2 
 
 		 410 aa  46.2  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  22.29 
 
 		 338 aa  45.8  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  21.77 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>