42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0342 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  100 
 
 		 328 aa  655    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  38.1 
 
 		 350 aa  216  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  34.9 
 
 		 347 aa  208  8e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  36.21 
 
 		 348 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  36.78 
 
 		 348 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  36.12 
 
 		 351 aa  205  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  36.21 
 
 		 348 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  36.49 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  35.92 
 
 		 348 aa  202  7e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  35.05 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  35.56 
 
 		 341 aa  193  3e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  34.59 
 
 		 341 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  34.38 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  32.59 
 
 		 356 aa  175  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  31.69 
 
 		 342 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  33.53 
 
 		 341 aa  170  4e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  31.09 
 
 		 355 aa  158  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  32.58 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  32.58 
 
 		 355 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  28.9 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  28.49 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  26.24 
 
 		 349 aa  105  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  23.8 
 
 		 413 aa  100  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  24.87 
 
 		 403 aa  96.3  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  28.29 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  25.54 
 
 		 330 aa  93.6  4e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  25.79 
 
 		 395 aa  89.4  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  24.71 
 
 		 330 aa  87.4  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  26.01 
 
 		 333 aa  87  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  25 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  29.71 
 
 		 338 aa  82.8  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  23.42 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  21.15 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  26.15 
 
 		 426 aa  59.7  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  25.24 
 
 		 410 aa  52.8  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  28.21 
 
 		 413 aa  52.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  22.27 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  26.58 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  25.63 
 
 		 406 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  21.58 
 
 		 417 aa  46.6  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  26.74 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  26.99 
 
 		 357 aa  43.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>