48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2010 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  78.95 
 
 		 419 aa  682    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  79.67 
 
 		 419 aa  669    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  80.96 
 
 		 417 aa  700    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 417 aa  855    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  78.31 
 
 		 416 aa  678    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 413 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  51.21 
 
 		 414 aa  421  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  49.88 
 
 		 415 aa  410  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  47.71 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  46.65 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 428 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  46.53 
 
 		 406 aa  373  1e-102  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  46.51 
 
 		 415 aa  362  1e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  39.56 
 
 		 410 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  37.65 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  39.02 
 
 		 419 aa  288  1e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  37.5 
 
 		 419 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  37.98 
 
 		 419 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  37.74 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  31.12 
 
 		 426 aa  228  1e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  32.34 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  36.28 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  36.91 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  36.28 
 
 		 389 aa  202  8e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  30.55 
 
 		 442 aa  199  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  31.28 
 
 		 457 aa  196  8.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  30.05 
 
 		 439 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  30.14 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  29.81 
 
 		 436 aa  186  8e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  32.01 
 
 		 357 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  34.35 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  30.47 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  30.5 
 
 		 362 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  29.82 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  25.51 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  26.15 
 
 		 347 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  24.62 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  25.62 
 
 		 355 aa  53.5  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  24.02 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  24.26 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  26.42 
 
 		 298 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  21.61 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  24.31 
 
 		 350 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  22.39 
 
 		 355 aa  46.6  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  21.58 
 
 		 328 aa  46.6  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  25 
 
 		 344 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>