51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1390 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  100 
 
 
347 aa  702    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  69.63 
 
 
350 aa  496  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  52.01 
 
 
351 aa  378  1e-103  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  45.69 
 
 
341 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  44.83 
 
 
341 aa  296  2e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  43.64 
 
 
340 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  43.4 
 
 
342 aa  281  1e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  40.22 
 
 
355 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  42.74 
 
 
355 aa  271  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  40.17 
 
 
356 aa  267  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  41.19 
 
 
341 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  40.59 
 
 
348 aa  261  8.999999999999999e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  40.47 
 
 
348 aa  259  6e-68  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  41.06 
 
 
355 aa  250  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  38.24 
 
 
348 aa  250  2e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  39.47 
 
 
348 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  39.83 
 
 
355 aa  248  9e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  37.65 
 
 
348 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  34.9 
 
 
328 aa  208  8e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  30.17 
 
 
344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  27.82 
 
 
413 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  28.86 
 
 
349 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  26.4 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  26.9 
 
 
330 aa  114  3e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  30 
 
 
341 aa  113  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  28.34 
 
 
383 aa  109  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  25.8 
 
 
330 aa  108  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  27.33 
 
 
332 aa  107  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  24.74 
 
 
415 aa  106  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  27.19 
 
 
337 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  27.46 
 
 
333 aa  103  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  26.98 
 
 
395 aa  99.4  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  28.35 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  23.77 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  26.15 
 
 
417 aa  55.1  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  22.55 
 
 
410 aa  54.7  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  28.28 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  27.62 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  26.87 
 
 
423 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  23.08 
 
 
417 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  24.38 
 
 
423 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  25.21 
 
 
357 aa  51.6  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  25.6 
 
 
358 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  33.02 
 
 
426 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  22.66 
 
 
419 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  23.88 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  26.13 
 
 
414 aa  47  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  26.24 
 
 
428 aa  46.2  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  24.63 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  28.33 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  24.4 
 
 
436 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>