38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2156 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  100 
 
 		 341 aa  676    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  56.23 
 
 		 344 aa  414  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  31.34 
 
 		 355 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  30.43 
 
 		 351 aa  135  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  30 
 
 		 347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  28.98 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  30.43 
 
 		 337 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  29.41 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  29.19 
 
 		 328 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  29.2 
 
 		 355 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  28.89 
 
 		 356 aa  119  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  27.89 
 
 		 348 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  27.89 
 
 		 348 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  30.37 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  27.32 
 
 		 348 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  28.05 
 
 		 348 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  27.95 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  28.73 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  26.7 
 
 		 341 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  27.54 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  29.07 
 
 		 330 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  30.46 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  29.77 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  27.7 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  26.29 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  25.29 
 
 		 342 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  23.88 
 
 		 413 aa  94  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  24.73 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  25.07 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  24.28 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  22.62 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  23.4 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  21.88 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  24.04 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  25.14 
 
 		 338 aa  53.5  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  23.25 
 
 		 410 aa  47  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  29.3 
 
 		 384 aa  47  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  29.2 
 
 		 385 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>