48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1289 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  80.96 
 
 		 417 aa  700    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  77.99 
 
 		 416 aa  669    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  100 
 
 		 417 aa  857    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  81.01 
 
 		 419 aa  677    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  79.33 
 
 		 419 aa  684    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  53.51 
 
 		 413 aa  430  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  51.31 
 
 		 414 aa  414  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  49.16 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  47.42 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  47.26 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  47.42 
 
 		 423 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  47.36 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  46.52 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  44.72 
 
 		 406 aa  358  9e-98  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  45.56 
 
 		 415 aa  348  7e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  39.12 
 
 		 410 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  36.84 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  38.28 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  37.23 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  37.17 
 
 		 419 aa  259  9e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  37.17 
 
 		 419 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  29.91 
 
 		 426 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  38.32 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  33.08 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  32.6 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  32.34 
 
 		 385 aa  200  5e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  31.77 
 
 		 457 aa  199  1.0000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  30.22 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  29.02 
 
 		 435 aa  196  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  29.83 
 
 		 442 aa  192  7e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  28.91 
 
 		 436 aa  189  5.999999999999999e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  37.03 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  34.29 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  33 
 
 		 338 aa  161  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  29.35 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.5 
 
 		 358 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  26.83 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  25.22 
 
 		 355 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  26.63 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  22.27 
 
 		 328 aa  50.4  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  24.55 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  24.49 
 
 		 355 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  30 
 
 		 341 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  26.88 
 
 		 339 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  24.63 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  24.88 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  28.36 
 
 		 355 aa  43.1  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  23.77 
 
 		 348 aa  43.1  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>