48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0863 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  100 
 
 
355 aa  711    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  90.99 
 
 
355 aa  632  1e-180  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  72.39 
 
 
356 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  72.96 
 
 
355 aa  513  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  69.01 
 
 
355 aa  503  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  41.06 
 
 
347 aa  263  4e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  41.74 
 
 
350 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  40.76 
 
 
351 aa  246  4e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  35.77 
 
 
342 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  33.14 
 
 
348 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  30.92 
 
 
348 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  30.9 
 
 
348 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  30.9 
 
 
348 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  34.99 
 
 
340 aa  205  8e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  34.41 
 
 
341 aa  199  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  31.4 
 
 
348 aa  196  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  33.33 
 
 
341 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  32.75 
 
 
341 aa  188  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  32.58 
 
 
328 aa  166  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  30.36 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  27.79 
 
 
403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  28.27 
 
 
383 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  27.55 
 
 
413 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  29.5 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  26.7 
 
 
349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  26.4 
 
 
415 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  26.48 
 
 
395 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  28.9 
 
 
332 aa  106  5e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  28.45 
 
 
330 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  28.13 
 
 
333 aa  104  3e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  26.35 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  25.5 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  24.84 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  28.25 
 
 
410 aa  59.7  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  27.88 
 
 
419 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  27.09 
 
 
416 aa  57  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  26.83 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  25.62 
 
 
417 aa  53.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  27.52 
 
 
406 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  28.22 
 
 
423 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  28.43 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  28.31 
 
 
357 aa  52.4  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  27.27 
 
 
338 aa  51.6  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  28.37 
 
 
419 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  27.27 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  33.33 
 
 
358 aa  49.7  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  26.03 
 
 
417 aa  48.1  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  26.24 
 
 
423 aa  43.9  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>