45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2121 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  100 
 
 		 355 aa  706    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  78.31 
 
 		 356 aa  558  1e-158  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  72.96 
 
 		 355 aa  517  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  73.8 
 
 		 355 aa  516  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  70.42 
 
 		 355 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  43.3 
 
 		 347 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  40.28 
 
 		 350 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  40.17 
 
 		 351 aa  249  8e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  34.76 
 
 		 340 aa  219  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  36.2 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  36.55 
 
 		 341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  32.55 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  31.78 
 
 		 348 aa  209  4e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  31.5 
 
 		 348 aa  210  4e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  31.49 
 
 		 348 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  35.78 
 
 		 341 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  34.02 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  30.32 
 
 		 348 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  31.09 
 
 		 328 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  28.34 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  30.66 
 
 		 344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  28 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  25.82 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  25.14 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  29.23 
 
 		 341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  29.78 
 
 		 330 aa  107  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  27.42 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  24.81 
 
 		 415 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  27.75 
 
 		 333 aa  100  6e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  27.14 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  26.8 
 
 		 337 aa  97.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  23.14 
 
 		 395 aa  95.9  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  23.36 
 
 		 338 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  26.13 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  23.27 
 
 		 417 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  26.51 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  26.37 
 
 		 415 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  25.77 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  24.2 
 
 		 426 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  33.33 
 
 		 358 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  23.41 
 
 		 419 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  25.11 
 
 		 423 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  24.02 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  25.45 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  24.24 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>