44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1591 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  97.13 
 
 
348 aa  684    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  96.26 
 
 
348 aa  681    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  100 
 
 
348 aa  697    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  78.74 
 
 
348 aa  588  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  70.98 
 
 
348 aa  521  1e-147  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  39.47 
 
 
347 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  36.54 
 
 
351 aa  246  6e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  38.01 
 
 
350 aa  241  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  34.23 
 
 
341 aa  230  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  34.03 
 
 
340 aa  230  3e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  34.53 
 
 
341 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  33.04 
 
 
342 aa  222  6e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  32.36 
 
 
355 aa  219  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  33.73 
 
 
341 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  31.78 
 
 
356 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  36.49 
 
 
328 aa  202  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  31.78 
 
 
355 aa  200  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  30.9 
 
 
355 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  29.74 
 
 
355 aa  186  7e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  30.19 
 
 
344 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  26.32 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  26.56 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  26.67 
 
 
383 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  26.8 
 
 
413 aa  124  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  25 
 
 
415 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  26.09 
 
 
349 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  25.07 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  27.61 
 
 
341 aa  102  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  24.35 
 
 
337 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  23.56 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  24.28 
 
 
330 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  25.28 
 
 
333 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  24.43 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  21.4 
 
 
358 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  27.69 
 
 
406 aa  53.1  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  24.62 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  24.75 
 
 
410 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  23.84 
 
 
417 aa  50.4  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  26.34 
 
 
423 aa  50.1  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  27.78 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  24.39 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  29.11 
 
 
338 aa  43.5  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  26.53 
 
 
415 aa  43.1  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4042  hypothetical protein  31.68 
 
 
134 aa  42.7  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0618632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>