44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0539 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  100 
 
 
342 aa  691    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  56.73 
 
 
341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  56.73 
 
 
341 aa  404  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  54.09 
 
 
340 aa  391  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  50.88 
 
 
341 aa  350  2e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  43.4 
 
 
347 aa  281  1e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  42.3 
 
 
351 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  40.06 
 
 
350 aa  249  5e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  34.82 
 
 
348 aa  226  3e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  33.33 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  33.04 
 
 
348 aa  222  6e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  32.44 
 
 
348 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  33.04 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  35.31 
 
 
356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  36.2 
 
 
355 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  33.91 
 
 
355 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  35.77 
 
 
355 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  34.72 
 
 
355 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  31.69 
 
 
328 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  24.52 
 
 
413 aa  106  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  26.38 
 
 
344 aa  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  27.83 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  24.73 
 
 
383 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  25.45 
 
 
403 aa  94.7  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  25.29 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  24.8 
 
 
415 aa  87  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  22.99 
 
 
395 aa  82.4  0.000000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  25.07 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  22.87 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  24.64 
 
 
333 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  24.09 
 
 
337 aa  57  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  21.98 
 
 
338 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  27.97 
 
 
358 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  21.6 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  26 
 
 
410 aa  50.1  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  32.89 
 
 
384 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  36 
 
 
362 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  24.64 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  27.5 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  31.13 
 
 
385 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  31.13 
 
 
385 aa  46.6  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  25.63 
 
 
406 aa  46.2  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  24.52 
 
 
417 aa  46.2  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  29.8 
 
 
389 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>