56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1077 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 406 aa  820    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  52.28 
 
 		 423 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 		 428 aa  426  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  50.24 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 		 417 aa  421  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  52.22 
 
 		 413 aa  420  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  49.4 
 
 		 423 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  47.7 
 
 		 414 aa  396  1e-109  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  48.3 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  47.43 
 
 		 410 aa  388  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  46.89 
 
 		 419 aa  388  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  48.52 
 
 		 419 aa  386  1e-106  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  49.04 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  46.53 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  47.29 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  47.37 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  45.52 
 
 		 416 aa  361  1e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  44.72 
 
 		 417 aa  358  9e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  48.33 
 
 		 419 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  48.07 
 
 		 419 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  43.81 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  35.48 
 
 		 426 aa  265  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  34.22 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  37.12 
 
 		 384 aa  243  3e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  32.93 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  33.82 
 
 		 439 aa  237  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  32.92 
 
 		 457 aa  237  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  36.2 
 
 		 389 aa  235  8e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  35.7 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  35.09 
 
 		 357 aa  234  3e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  35.44 
 
 		 385 aa  233  5e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  32.43 
 
 		 442 aa  232  7.000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  36.13 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  39.1 
 
 		 390 aa  220  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  29.1 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.39 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  24.56 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  25.48 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  29.59 
 
 		 348 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  27.69 
 
 		 348 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  27.18 
 
 		 348 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  27.69 
 
 		 348 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  26.94 
 
 		 350 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  27.98 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  27.62 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  28.11 
 
 		 355 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  25.63 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  25.96 
 
 		 348 aa  47.8  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  25.63 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  25.49 
 
 		 355 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  21.66 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  27.56 
 
 		 339 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  25.77 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  31.65 
 
 		 341 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  24.75 
 
 		 383 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2897  hypothetical protein  20.65 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.200479 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>