38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1565 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  100 
 
 		 340 aa  684    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  60.59 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  60 
 
 		 341 aa  435  1e-121  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  54.09 
 
 		 342 aa  391  1e-108  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  55.59 
 
 		 341 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  43.64 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  43.4 
 
 		 351 aa  272  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  40.06 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  34.03 
 
 		 348 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  33.13 
 
 		 348 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  33.13 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  34.76 
 
 		 355 aa  216  5e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  32.84 
 
 		 348 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  33.81 
 
 		 356 aa  209  7e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  31.34 
 
 		 348 aa  206  6e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  33.24 
 
 		 355 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  35.05 
 
 		 328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  34.99 
 
 		 355 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  34.29 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  27.51 
 
 		 344 aa  109  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  27.78 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  26.63 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  25.41 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  23.22 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  25.57 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  26.89 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  25.59 
 
 		 415 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  26.15 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  22.93 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  23.8 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  24.42 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  24.56 
 
 		 330 aa  67.4  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  24.63 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  25.77 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  24.88 
 
 		 410 aa  44.7  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  25.51 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  25.85 
 
 		 423 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  24.22 
 
 		 357 aa  42.7  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>