53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2836 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  75.3 
 
 		 417 aa  659    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  77.54 
 
 		 423 aa  690    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  76.36 
 
 		 423 aa  686    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 423 aa  862    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  70.81 
 
 		 428 aa  620  1e-177  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  57.21 
 
 		 413 aa  489  1e-137  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  59.28 
 
 		 415 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  55.9 
 
 		 414 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  52.28 
 
 		 406 aa  430  1e-119  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  48.31 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  47.42 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  47.78 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  46.1 
 
 		 416 aa  379  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  46.84 
 
 		 419 aa  372  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  46.62 
 
 		 419 aa  345  1e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  42.45 
 
 		 410 aa  344  2e-93  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  42.86 
 
 		 419 aa  342  1e-92  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  42.68 
 
 		 419 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  42.68 
 
 		 419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  41.95 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  35.21 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  30.91 
 
 		 435 aa  231  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  31.5 
 
 		 457 aa  230  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  31.15 
 
 		 439 aa  221  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  30.28 
 
 		 436 aa  220  3.9999999999999997e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  31.46 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  35.94 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  36.73 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  30.27 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  30.02 
 
 		 389 aa  187  4e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  29.53 
 
 		 385 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  29.28 
 
 		 385 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  35.56 
 
 		 390 aa  180  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.16 
 
 		 358 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  27.27 
 
 		 362 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  26.24 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  27.63 
 
 		 350 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  24.38 
 
 		 347 aa  52  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  27.27 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  26.34 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  25.48 
 
 		 348 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  25.37 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  28.57 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  25.97 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  26.58 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  23.74 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  24 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  27.34 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  23.56 
 
 		 348 aa  45.4  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  30.09 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0601  hypothetical protein  24.83 
 
 		 388 aa  43.5  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  26.74 
 
 		 355 aa  43.5  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>