42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0270 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 423 aa  863    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  80.05 
 
 		 423 aa  702    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  75.06 
 
 		 417 aa  653    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  77.54 
 
 		 423 aa  690    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  68.66 
 
 		 428 aa  616  1e-175  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 413 aa  475  1e-133  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  55.18 
 
 		 415 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  52.53 
 
 		 414 aa  441  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  49.4 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  47.42 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 415 aa  381  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  46.63 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  44.73 
 
 		 419 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  44.44 
 
 		 416 aa  363  2e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  45.67 
 
 		 419 aa  362  9e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  45.41 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  41.97 
 
 		 410 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  42.13 
 
 		 419 aa  335  7e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  40.53 
 
 		 419 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  41.95 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  41.22 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  34.98 
 
 		 426 aa  279  9e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  30.05 
 
 		 435 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  29.36 
 
 		 457 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  29.72 
 
 		 436 aa  208  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  31.15 
 
 		 439 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  30.05 
 
 		 442 aa  193  5e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  33.33 
 
 		 357 aa  189  8e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  30.77 
 
 		 384 aa  186  6e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  35.62 
 
 		 338 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  30.27 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  29.78 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  29.78 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  27.03 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  31.85 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  27.34 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  27.23 
 
 		 298 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  28.22 
 
 		 355 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  30 
 
 		 339 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  23.88 
 
 		 347 aa  47.4  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  25 
 
 		 355 aa  46.6  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0601  hypothetical protein  25.5 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427399  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>