39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1509 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 428 aa  878    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  73.25 
 
 		 417 aa  632  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  70.81 
 
 		 423 aa  620  1e-176  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  68.66 
 
 		 423 aa  616  1e-175  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  69.88 
 
 		 423 aa  610  1e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  56.52 
 
 		 413 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  54.83 
 
 		 414 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  55.66 
 
 		 415 aa  464  1e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  51.68 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 415 aa  411  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  47.65 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  45.63 
 
 		 417 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  45.02 
 
 		 416 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  46.44 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  46.52 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  46.1 
 
 		 419 aa  360  3e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  48.05 
 
 		 419 aa  353  4e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  46.21 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  46.7 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  46.21 
 
 		 419 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  40.48 
 
 		 410 aa  315  7e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  34.03 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  29.98 
 
 		 457 aa  201  3e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  30.3 
 
 		 436 aa  201  3e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  28.74 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  29.83 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  29.61 
 
 		 442 aa  193  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  30.24 
 
 		 439 aa  193  5e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  34.82 
 
 		 357 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  29.34 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  28.61 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  28.85 
 
 		 385 aa  182  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  35.25 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  34.49 
 
 		 390 aa  167  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  28.99 
 
 		 362 aa  164  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  26.96 
 
 		 358 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  26.24 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  25.84 
 
 		 298 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  23.38 
 
 		 348 aa  44.7  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>