41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1818 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  100 
 
 
385 aa  789    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  91.43 
 
 
389 aa  744    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  85.94 
 
 
384 aa  705    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  96.88 
 
 
385 aa  772    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  65.19 
 
 
390 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  37.5 
 
 
357 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  40.19 
 
 
410 aa  235  8e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  35.7 
 
 
406 aa  235  9e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  31.85 
 
 
419 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  33.08 
 
 
416 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  31.83 
 
 
419 aa  203  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  36.28 
 
 
417 aa  203  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  30.98 
 
 
413 aa  202  8e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  35.21 
 
 
338 aa  201  1.9999999999999998e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  32.34 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  29.68 
 
 
417 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  29.82 
 
 
414 aa  193  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  30.58 
 
 
415 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  35.71 
 
 
419 aa  192  1e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  30.26 
 
 
423 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  29.53 
 
 
423 aa  185  9e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  28.61 
 
 
428 aa  182  6e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  33.44 
 
 
415 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  36.93 
 
 
419 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  29.78 
 
 
423 aa  175  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  35.28 
 
 
419 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  35.57 
 
 
419 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  35.23 
 
 
419 aa  167  4e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  28.9 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  30.74 
 
 
439 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  30.5 
 
 
435 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  29.97 
 
 
442 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  27.25 
 
 
358 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  29.26 
 
 
436 aa  142  8e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  26.79 
 
 
457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  25.84 
 
 
362 aa  133  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  24.69 
 
 
349 aa  53.9  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  24.06 
 
 
298 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  31.13 
 
 
342 aa  47.4  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  22.45 
 
 
413 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  27.21 
 
 
369 aa  43.1  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>