39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0355 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  85.94 
 
 		 385 aa  705    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  84.11 
 
 		 389 aa  699    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 384 aa  786    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  86.98 
 
 		 385 aa  711    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  66.49 
 
 		 390 aa  526  1e-148  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  37.12 
 
 		 406 aa  243  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  37.46 
 
 		 357 aa  236  6e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  40.65 
 
 		 410 aa  236  6e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  33.58 
 
 		 419 aa  212  9e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  32.16 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  34.09 
 
 		 419 aa  209  9e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  33.59 
 
 		 416 aa  208  1e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  31.39 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  38.32 
 
 		 417 aa  203  3e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  36.91 
 
 		 417 aa  202  6e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  31.79 
 
 		 423 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  34.91 
 
 		 338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  31.08 
 
 		 415 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  30.33 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  29.83 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  36.89 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  30.27 
 
 		 423 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  34.97 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  30.77 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  37.25 
 
 		 419 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  37.42 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  37.46 
 
 		 419 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  37.12 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  29.97 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  29.11 
 
 		 439 aa  158  1e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  31.22 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.93 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  30.55 
 
 		 436 aa  143  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  27.69 
 
 		 457 aa  140  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  28.94 
 
 		 442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  27.27 
 
 		 362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  25.1 
 
 		 349 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  32.89 
 
 		 342 aa  49.7  0.00009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  24.77 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>