52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0359 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 413 aa  843    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  64.96 
 
 		 414 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  64.89 
 
 		 415 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  58.75 
 
 		 417 aa  501  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  57.63 
 
 		 415 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  57.21 
 
 		 423 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  55.88 
 
 		 423 aa  478  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  56.25 
 
 		 423 aa  475  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  56.52 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  52.67 
 
 		 419 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  53.51 
 
 		 417 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  52.09 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  52.22 
 
 		 406 aa  420  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  51.36 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  51.82 
 
 		 419 aa  410  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  48.1 
 
 		 419 aa  366  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  44.5 
 
 		 419 aa  364  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  45.57 
 
 		 410 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  46.15 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  45.67 
 
 		 419 aa  329  4e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  45.67 
 
 		 419 aa  328  8e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  34.87 
 
 		 426 aa  258  1e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  30.86 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  30.86 
 
 		 436 aa  222  9e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  31.07 
 
 		 439 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  30.54 
 
 		 457 aa  216  4e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  32.49 
 
 		 389 aa  210  4e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  32.16 
 
 		 384 aa  210  4e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  31.46 
 
 		 442 aa  209  6e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  31.23 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  30.98 
 
 		 385 aa  202  9e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  31.5 
 
 		 357 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  36.27 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  36.94 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  27.38 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  27.18 
 
 		 358 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  23.04 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  25.69 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  24.55 
 
 		 348 aa  55.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  23.77 
 
 		 347 aa  55.5  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  29.14 
 
 		 298 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  24.7 
 
 		 348 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  24.62 
 
 		 348 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  28.21 
 
 		 328 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  23.88 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  31.21 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  24.64 
 
 		 342 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  19.76 
 
 		 369 aa  47  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  28.14 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  24.89 
 
 		 351 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  25.51 
 
 		 340 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  26.26 
 
 		 356 aa  43.1  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>