41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2924 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  100 
 
 
356 aa  705    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  78.31 
 
 
355 aa  549  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  72.39 
 
 
355 aa  502  1e-141  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  70.99 
 
 
355 aa  501  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  70.99 
 
 
355 aa  488  1e-137  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  40.17 
 
 
347 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  40.34 
 
 
350 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  38.76 
 
 
351 aa  239  4e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  35.31 
 
 
342 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  35.9 
 
 
341 aa  210  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  32.85 
 
 
348 aa  209  6e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  33.81 
 
 
340 aa  209  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  35.88 
 
 
341 aa  207  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  31.5 
 
 
348 aa  205  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  31.49 
 
 
348 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  31.78 
 
 
348 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  34.22 
 
 
341 aa  200  3.9999999999999996e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  31.4 
 
 
348 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  32.59 
 
 
328 aa  175  8e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  31.02 
 
 
344 aa  133  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  27.34 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  25.4 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  28.04 
 
 
383 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  26.78 
 
 
349 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  28.61 
 
 
341 aa  109  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  25.89 
 
 
415 aa  105  8e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  24.94 
 
 
395 aa  99  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  25.71 
 
 
337 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  26.97 
 
 
330 aa  93.6  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  25.79 
 
 
332 aa  89  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  25.7 
 
 
330 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  25.82 
 
 
333 aa  86.7  6e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  24.38 
 
 
338 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  25.24 
 
 
419 aa  53.5  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  24.26 
 
 
417 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  23.5 
 
 
416 aa  49.7  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  34.02 
 
 
358 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  25.9 
 
 
357 aa  46.2  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  24.88 
 
 
417 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  25.11 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  26.26 
 
 
413 aa  43.1  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>