32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0556 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  100 
 
 
337 aa  639    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  34.14 
 
 
330 aa  144  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  33.43 
 
 
332 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  34.14 
 
 
330 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  32.53 
 
 
333 aa  137  2e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  32.3 
 
 
338 aa  123  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  27.11 
 
 
350 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  30.43 
 
 
341 aa  108  9.000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  27.19 
 
 
347 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  26.72 
 
 
348 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  25.14 
 
 
348 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  24.57 
 
 
348 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  24.35 
 
 
348 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  25.22 
 
 
349 aa  99.8  6e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  25 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  25.71 
 
 
356 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  26.93 
 
 
355 aa  92  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  26.22 
 
 
355 aa  92.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  27.41 
 
 
351 aa  90.9  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  28.45 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  26.21 
 
 
355 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  23.85 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  25 
 
 
328 aa  84.3  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  24.78 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  25.44 
 
 
341 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  23.8 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  22.01 
 
 
415 aa  64.7  0.000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  22.59 
 
 
395 aa  64.3  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  24.34 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  24.09 
 
 
342 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  19.37 
 
 
413 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  23.82 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>