44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1329 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  100 
 
 
341 aa  680    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  64.41 
 
 
341 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  60.59 
 
 
340 aa  437  1e-121  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  56.73 
 
 
342 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  55.59 
 
 
341 aa  390  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  44.83 
 
 
347 aa  296  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  45.24 
 
 
351 aa  285  9e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  42.12 
 
 
350 aa  272  6e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  34.53 
 
 
348 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  34.23 
 
 
348 aa  225  8e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  33.93 
 
 
348 aa  225  9e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  33.33 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  33.03 
 
 
348 aa  209  4e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  34.87 
 
 
355 aa  205  8e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  34.22 
 
 
356 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  34.02 
 
 
355 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  35.56 
 
 
328 aa  193  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  32.75 
 
 
355 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  32.84 
 
 
355 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  26.43 
 
 
413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  25.73 
 
 
349 aa  110  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  25.9 
 
 
383 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  25 
 
 
403 aa  104  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  26.39 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  24.34 
 
 
415 aa  92.8  7e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  23.88 
 
 
395 aa  87.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  28.33 
 
 
330 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  24.72 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  24.08 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  25.29 
 
 
332 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  24.78 
 
 
330 aa  74.3  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  28.86 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  25.44 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  26.26 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  30 
 
 
417 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  33.59 
 
 
358 aa  46.6  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  28.14 
 
 
413 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  27.34 
 
 
423 aa  46.2  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  31.65 
 
 
406 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  22.9 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  25.48 
 
 
357 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  33.67 
 
 
362 aa  43.1  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  28 
 
 
415 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  28.47 
 
 
417 aa  42.7  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>