31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1858 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  100 
 
 
338 aa  661    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  32.06 
 
 
333 aa  171  2e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  32.07 
 
 
330 aa  168  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  32.45 
 
 
330 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  31.36 
 
 
332 aa  157  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  32.46 
 
 
337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  29.63 
 
 
350 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  29.48 
 
 
347 aa  116  6e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  27.43 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  29.71 
 
 
328 aa  109  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  30.46 
 
 
341 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  29.8 
 
 
351 aa  107  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  26.8 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  25.84 
 
 
348 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  28.86 
 
 
341 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  26.61 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  24.43 
 
 
348 aa  92  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  24.43 
 
 
348 aa  89.4  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  26.74 
 
 
341 aa  86.3  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  26.5 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  24.36 
 
 
348 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  24.38 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  25.28 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  24.21 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  23.35 
 
 
355 aa  72.8  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  24.44 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  22.5 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  22.32 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  21.89 
 
 
383 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  24.35 
 
 
395 aa  49.7  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  32.61 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>