42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0862 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  100 
 
 
348 aa  697    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  96.26 
 
 
348 aa  681    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  97.41 
 
 
348 aa  686    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  78.16 
 
 
348 aa  587  1e-166  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  71.26 
 
 
348 aa  527  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  38.24 
 
 
347 aa  250  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  36.54 
 
 
351 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  38.3 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  34.23 
 
 
341 aa  231  1e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  33.13 
 
 
340 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  33.93 
 
 
341 aa  225  1e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  33.33 
 
 
342 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  31.79 
 
 
355 aa  218  7.999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  33.73 
 
 
341 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  31.5 
 
 
356 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  35.92 
 
 
328 aa  202  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  31.5 
 
 
355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  30.92 
 
 
355 aa  195  9e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  29.77 
 
 
355 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  31.02 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  26.76 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  24.93 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  25.53 
 
 
395 aa  126  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  25.54 
 
 
383 aa  124  3e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  26.09 
 
 
349 aa  116  5e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  23.71 
 
 
415 aa  110  3e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  24.71 
 
 
332 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  27.04 
 
 
341 aa  100  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  24.57 
 
 
337 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  25.63 
 
 
333 aa  97.8  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  23.34 
 
 
330 aa  96.7  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  25.07 
 
 
330 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  24.43 
 
 
338 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  20.74 
 
 
358 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  27.18 
 
 
406 aa  53.9  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  24.24 
 
 
410 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  23.88 
 
 
413 aa  50.1  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  25.37 
 
 
423 aa  49.3  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  28.49 
 
 
417 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  22.7 
 
 
419 aa  46.2  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  25.2 
 
 
362 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  25.38 
 
 
415 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>