49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2212 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  75.06 
 
 		 423 aa  653    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  77.94 
 
 		 423 aa  676    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 417 aa  847    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  75.3 
 
 		 423 aa  659    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  73.25 
 
 		 428 aa  632  1e-180  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  58.75 
 
 		 413 aa  501  1e-141  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  57 
 
 		 415 aa  476  1e-133  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  56.73 
 
 		 414 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  51.8 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  50.36 
 
 		 415 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  47.37 
 
 		 419 aa  392  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  47.26 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  46.65 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  47.34 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  47.61 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  46.97 
 
 		 419 aa  363  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  44.31 
 
 		 419 aa  348  8e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  45.61 
 
 		 419 aa  340  4e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  42.21 
 
 		 410 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  45.85 
 
 		 419 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  45.37 
 
 		 419 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  34.36 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  31.48 
 
 		 435 aa  227  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  30.26 
 
 		 457 aa  225  1e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  29.88 
 
 		 436 aa  213  2.9999999999999995e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  31.07 
 
 		 439 aa  212  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  29.81 
 
 		 442 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  31.39 
 
 		 384 aa  207  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  29.68 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  29.78 
 
 		 389 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  29.44 
 
 		 385 aa  197  3e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  33.84 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  35.69 
 
 		 338 aa  186  9e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  35.24 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.33 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  26.85 
 
 		 362 aa  150  5e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  25.97 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  23.08 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  23.84 
 
 		 348 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  25.56 
 
 		 339 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  23.84 
 
 		 348 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  27.86 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  28.49 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  26.03 
 
 		 355 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  25.96 
 
 		 355 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  31.86 
 
 		 348 aa  46.6  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  24.52 
 
 		 342 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  26.63 
 
 		 351 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  28.43 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>