39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0303 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  96.88 
 
 		 385 aa  772    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  91.69 
 
 		 389 aa  745    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  86.98 
 
 		 384 aa  711    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 385 aa  785    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  66.02 
 
 		 390 aa  518  1e-146  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  37.5 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  40.65 
 
 		 410 aa  236  7e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  35.44 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  32.59 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  33.84 
 
 		 416 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  32.58 
 
 		 419 aa  206  5e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  32.34 
 
 		 417 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  35.5 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  31.23 
 
 		 413 aa  203  4e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  32.6 
 
 		 417 aa  202  5e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  29.44 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  30.33 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  31.08 
 
 		 415 aa  196  6e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  36.36 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  30.51 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  29.28 
 
 		 423 aa  183  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  34.09 
 
 		 415 aa  184  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  28.85 
 
 		 428 aa  182  7e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  37.25 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  29.78 
 
 		 423 aa  175  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  35.92 
 
 		 419 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  36.24 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  35.91 
 
 		 419 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  29.19 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  28.89 
 
 		 439 aa  159  9e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  30.21 
 
 		 435 aa  155  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  29.66 
 
 		 442 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  27.81 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  28.94 
 
 		 436 aa  140  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  27.51 
 
 		 457 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  26.35 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  22.22 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  24.06 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  31.13 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>