39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3257 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  39.46 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0151  hypothetical protein  32.21 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328625  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1602  hypothetical protein  30.92 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0714665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1377  hypothetical protein  28.03 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.587358  normal  0.305884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3008  hypothetical protein  29.15 
 
 		 296 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.01667  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  28.72 
 
 		 423 aa  62.8  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  25.48 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  26.24 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0591  hypothetical protein  27.88 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  25.97 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  28.09 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  27.23 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  29.19 
 
 		 338 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  29.14 
 
 		 413 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  26.63 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  25 
 
 		 389 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  26.6 
 
 		 419 aa  50.1  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  26.42 
 
 		 417 aa  49.7  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  24.77 
 
 		 384 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  24.06 
 
 		 385 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  27.95 
 
 		 414 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2291  hypothetical protein  43.86 
 
 		 363 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  26.34 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  31.75 
 
 		 415 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  25.35 
 
 		 419 aa  47  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.47 
 
 		 358 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  27.03 
 
 		 439 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  24.41 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  24.06 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  21.3 
 
 		 426 aa  46.6  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  25.84 
 
 		 428 aa  46.2  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  24.49 
 
 		 419 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  24.41 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  28.03 
 
 		 436 aa  43.9  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  26.06 
 
 		 390 aa  43.5  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3090  hypothetical protein  27.74 
 
 		 367 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.241646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5973  hypothetical protein  28.57 
 
 		 218 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342038  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  26.67 
 
 		 415 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>