23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3090 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3090  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  707    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.241646  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3407  hypothetical protein  71.75 
 
 
368 aa  471  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.741833  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2292  hypothetical protein  37.54 
 
 
374 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594734  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2140  hypothetical protein  37.54 
 
 
374 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4176  hypothetical protein  33.9 
 
 
360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.777473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3418  hypothetical protein  34.87 
 
 
377 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0160  hypothetical protein  33.97 
 
 
361 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24340  hypothetical protein  29.79 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49719  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2566  hypothetical protein  33.55 
 
 
356 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.581205  normal  0.605973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2945  hypothetical protein  33.98 
 
 
379 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0034  hypothetical protein  30.75 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01810  hypothetical protein  29.56 
 
 
366 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22370  hypothetical protein  28.72 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439522  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2128  hypothetical protein  28.24 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1404  hypothetical protein  30.56 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1397  hypothetical protein  32.62 
 
 
400 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12648  hypothetical protein  27.22 
 
 
374 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5401  hypothetical protein  32.66 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2775  hypothetical protein  26.58 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365016  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2789  hypothetical protein  26.58 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2745  hypothetical protein  26.58 
 
 
366 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1124  hypothetical protein  25.93 
 
 
418 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  27.74 
 
 
298 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.471093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>