22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3407 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3407  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  716    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.741833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3090  hypothetical protein  71.75 
 
 		 367 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.241646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2292  hypothetical protein  37.53 
 
 		 374 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594734  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2140  hypothetical protein  37.02 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4176  hypothetical protein  32.77 
 
 		 360 aa  138  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.777473  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24340  hypothetical protein  31.91 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0160  hypothetical protein  37.33 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0034  hypothetical protein  32.79 
 
 		 375 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2566  hypothetical protein  33.65 
 
 		 356 aa  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.581205  normal  0.605973 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3418  hypothetical protein  31.62 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2945  hypothetical protein  34.95 
 
 		 379 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01810  hypothetical protein  30.7 
 
 		 366 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1397  hypothetical protein  34.04 
 
 		 400 aa  92.8  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2128  hypothetical protein  28.01 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22370  hypothetical protein  26.81 
 
 		 368 aa  79.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439522  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1124  hypothetical protein  27.64 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5401  hypothetical protein  35.53 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1404  hypothetical protein  28.19 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2775  hypothetical protein  27.59 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365016  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2789  hypothetical protein  27.59 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2745  hypothetical protein  27.59 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12648  hypothetical protein  27.27 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>