23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2566 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2566  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  694    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.581205  normal  0.605973 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4176  hypothetical protein  41.76 
 
 
360 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.777473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2292  hypothetical protein  39.12 
 
 
374 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594734  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2140  hypothetical protein  37.74 
 
 
374 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24340  hypothetical protein  31.55 
 
 
398 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49719  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3418  hypothetical protein  31.19 
 
 
377 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01810  hypothetical protein  29.73 
 
 
366 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22370  hypothetical protein  34.64 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439522  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0034  hypothetical protein  33.69 
 
 
375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0160  hypothetical protein  32.32 
 
 
361 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3407  hypothetical protein  33.65 
 
 
368 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.741833  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3090  hypothetical protein  33.14 
 
 
367 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.241646  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1124  hypothetical protein  28.72 
 
 
418 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1397  hypothetical protein  30.5 
 
 
400 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1404  hypothetical protein  29.65 
 
 
368 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12648  hypothetical protein  28.49 
 
 
374 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2775  hypothetical protein  26.34 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365016  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2789  hypothetical protein  26.34 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2745  hypothetical protein  26.34 
 
 
366 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2128  hypothetical protein  28.91 
 
 
382 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5401  hypothetical protein  31.52 
 
 
308 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2945  hypothetical protein  29.49 
 
 
379 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0601  hypothetical protein  31.01 
 
 
388 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>