23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01810  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  721    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2745  hypothetical protein  39.46 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2789  hypothetical protein  39.46 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2775  hypothetical protein  39.46 
 
 		 366 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365016  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12648  hypothetical protein  37.74 
 
 		 374 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1404  hypothetical protein  35.25 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4176  hypothetical protein  33.97 
 
 		 360 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.777473  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3418  hypothetical protein  33.43 
 
 		 377 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2292  hypothetical protein  31.89 
 
 		 374 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594734  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5401  hypothetical protein  34.07 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2140  hypothetical protein  31.89 
 
 		 374 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0034  hypothetical protein  31.12 
 
 		 375 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2566  hypothetical protein  29.73 
 
 		 356 aa  125  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.581205  normal  0.605973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0160  hypothetical protein  33.15 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24340  hypothetical protein  28.95 
 
 		 398 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3407  hypothetical protein  30.81 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.741833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22370  hypothetical protein  30.05 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439522  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3090  hypothetical protein  29.56 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.241646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2128  hypothetical protein  28.65 
 
 		 382 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1124  hypothetical protein  27.45 
 
 		 418 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1397  hypothetical protein  30.21 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2945  hypothetical protein  31.96 
 
 		 379 aa  59.7  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  26.07 
 
 		 410 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>