22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3418 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  747    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0034  hypothetical protein  35 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2566  hypothetical protein  31.19 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.581205  normal  0.605973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2140  hypothetical protein  31.69 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2292  hypothetical protein  31.69 
 
 		 374 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594734  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01810  hypothetical protein  33.43 
 
 		 366 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24340  hypothetical protein  29.69 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4176  hypothetical protein  31.28 
 
 		 360 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.777473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3090  hypothetical protein  34.32 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.241646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0160  hypothetical protein  34.23 
 
 		 361 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2745  hypothetical protein  30.87 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2789  hypothetical protein  30.87 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2775  hypothetical protein  30.87 
 
 		 366 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365016  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3407  hypothetical protein  34.24 
 
 		 368 aa  122  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.741833  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1397  hypothetical protein  30.77 
 
 		 400 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22370  hypothetical protein  28.53 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439522  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1124  hypothetical protein  28.54 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1404  hypothetical protein  28.88 
 
 		 368 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12648  hypothetical protein  27.76 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5401  hypothetical protein  29.77 
 
 		 308 aa  72.4  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2128  hypothetical protein  24.6 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2945  hypothetical protein  29.45 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>