22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2292 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2140  hypothetical protein  92.51 
 
 
374 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2292  hypothetical protein  100 
 
 
374 aa  729    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594734  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4176  hypothetical protein  41.89 
 
 
360 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.777473  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2566  hypothetical protein  39.12 
 
 
356 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.581205  normal  0.605973 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0034  hypothetical protein  37.87 
 
 
375 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0160  hypothetical protein  37.43 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3407  hypothetical protein  37.85 
 
 
368 aa  168  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.741833  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24340  hypothetical protein  30.63 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49719  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3090  hypothetical protein  37.54 
 
 
367 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.241646  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3418  hypothetical protein  31.91 
 
 
377 aa  149  6e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01810  hypothetical protein  31.89 
 
 
366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1404  hypothetical protein  32.25 
 
 
368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1397  hypothetical protein  31.25 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2775  hypothetical protein  31.66 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365016  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2789  hypothetical protein  31.66 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2745  hypothetical protein  31.66 
 
 
366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1124  hypothetical protein  26.76 
 
 
418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12648  hypothetical protein  27.89 
 
 
374 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2128  hypothetical protein  27.36 
 
 
382 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22370  hypothetical protein  27.13 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439522  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5401  hypothetical protein  27.85 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2945  hypothetical protein  30.62 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>