22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1188 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  693    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  39.46 
 
 
298 aa  226  6e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0151  hypothetical protein  26.9 
 
 
305 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328625  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0591  hypothetical protein  24.92 
 
 
317 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1377  hypothetical protein  22.98 
 
 
297 aa  73.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.587358  normal  0.305884 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2291  hypothetical protein  43.68 
 
 
363 aa  63.5  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1602  hypothetical protein  24.35 
 
 
302 aa  59.3  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0714665 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3008  hypothetical protein  24.44 
 
 
296 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.01667  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  30.63 
 
 
415 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  25.56 
 
 
417 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  30.2 
 
 
423 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  30 
 
 
423 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  31.21 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  28.57 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  29.46 
 
 
358 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  26.53 
 
 
415 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  26.88 
 
 
417 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  26.34 
 
 
419 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  27.56 
 
 
406 aa  45.4  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  26.34 
 
 
419 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  24.73 
 
 
416 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  34.78 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>