51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3174 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  93.79 
 
 		 419 aa  822    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  100 
 
 		 419 aa  861    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  81.01 
 
 		 417 aa  695    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  79.67 
 
 		 417 aa  686    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  79.71 
 
 		 416 aa  703    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  51.82 
 
 		 413 aa  421  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  50.84 
 
 		 414 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  49.88 
 
 		 415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  47.61 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  46.84 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  47.02 
 
 		 423 aa  385  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  47.29 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  46.74 
 
 		 428 aa  381  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  46.39 
 
 		 423 aa  373  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  46.04 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  39.85 
 
 		 410 aa  311  1e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  38.42 
 
 		 419 aa  300  3e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  39.71 
 
 		 419 aa  291  2e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  38.93 
 
 		 419 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  38.87 
 
 		 419 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  38.62 
 
 		 419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  31.44 
 
 		 426 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  34.84 
 
 		 384 aa  218  1e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  33.58 
 
 		 389 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  32.84 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  32.1 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  31.05 
 
 		 457 aa  200  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  30 
 
 		 435 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  30.42 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  30.96 
 
 		 442 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  29.72 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  36.51 
 
 		 357 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  36.08 
 
 		 390 aa  182  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  35.69 
 
 		 338 aa  175  1.9999999999999998e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  30.81 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  28.36 
 
 		 358 aa  150  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  28.37 
 
 		 355 aa  57.8  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  24.04 
 
 		 355 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  22.44 
 
 		 369 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  25.38 
 
 		 355 aa  50.8  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  25.74 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  25.35 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  26.34 
 
 		 339 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  23.9 
 
 		 356 aa  46.2  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  23.38 
 
 		 348 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  23.38 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  29.46 
 
 		 344 aa  45.1  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  23.38 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  23.76 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  22.96 
 
 		 348 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  21.67 
 
 		 347 aa  43.1  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>