54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0153 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 357 aa  719    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  71.39 
 
 		 338 aa  504  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  37.06 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  37.5 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  37.5 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  37.46 
 
 		 384 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  35.09 
 
 		 406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  39.1 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  35.28 
 
 		 389 aa  228  1e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  37.92 
 
 		 390 aa  226  3e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  39.42 
 
 		 419 aa  205  8e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  35.94 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  39.66 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  39.66 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  37.94 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  29.9 
 
 		 423 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  31.5 
 
 		 413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  33.84 
 
 		 417 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  33.33 
 
 		 423 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  34.82 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  34.08 
 
 		 415 aa  186  6e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  36.1 
 
 		 419 aa  186  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  32.01 
 
 		 417 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  34.08 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  36.51 
 
 		 419 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  29.21 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  33.12 
 
 		 416 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  34.29 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  28.96 
 
 		 435 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  31.69 
 
 		 415 aa  169  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  29.21 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  29.48 
 
 		 457 aa  163  5.0000000000000005e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  28.47 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  27.43 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  26.84 
 
 		 358 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  25.84 
 
 		 362 aa  122  7e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  30 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  29.27 
 
 		 355 aa  59.3  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  28.09 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  25.86 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  22.85 
 
 		 395 aa  53.1  0.000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  28.48 
 
 		 355 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  25.21 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  26.37 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  23.5 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  24.83 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  27.5 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  25.15 
 
 		 355 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  26.71 
 
 		 348 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  25.32 
 
 		 350 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  25.9 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  25.48 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  26.99 
 
 		 328 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  24.22 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>