48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2861 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  100 
 
 		 355 aa  716    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  90.99 
 
 		 355 aa  632  1e-180  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  73.8 
 
 		 355 aa  514  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  70.99 
 
 		 356 aa  502  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  68.45 
 
 		 355 aa  495  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  39.83 
 
 		 347 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  40.39 
 
 		 350 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  39.59 
 
 		 351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  33.14 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  34.72 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  29.77 
 
 		 348 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  29.74 
 
 		 348 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  29.74 
 
 		 348 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1565  translation factor pelota  34.29 
 
 		 340 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.718031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  33.33 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  33.43 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  29.94 
 
 		 348 aa  189  7e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  32.84 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.520708 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  32.58 
 
 		 328 aa  161  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  31.53 
 
 		 344 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24748  predicted protein  28.42 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44170  predicted protein  27.93 
 
 		 383 aa  125  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.717736  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04530  translation factor pelota, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02960)  26.75 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.664166  decreased coverage  0.00419597 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  29.71 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  27.56 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  25.89 
 
 		 415 aa  109  7.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  26.1 
 
 		 395 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0491  eRF1 domain-containing 1 protein  28.17 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1763  cell division protein pelota  28.21 
 
 		 332 aa  103  7e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000803667 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1534  eRF1 domain-containing 1 protein  25.91 
 
 		 330 aa  98.6  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1714  eRF1 domain-containing 1 protein  28.3 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.839139  normal  0.0545178 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0556  eRF1 domain-containing protein  26.91 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  29.09 
 
 		 357 aa  59.7  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  27.36 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1858  eRF1 domain-containing protein  24.01 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.61394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  26.54 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  26.9 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  25.36 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  24.02 
 
 		 417 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  25.22 
 
 		 417 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  25.7 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  26.94 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  24.04 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  25 
 
 		 417 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  25 
 
 		 423 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  25.49 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  23.88 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  22.85 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>