54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0749 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 338 aa  682    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  71.39 
 
 		 357 aa  520  1e-146  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  40 
 
 		 410 aa  278  1e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  36.91 
 
 		 406 aa  230  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  39.73 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  35.5 
 
 		 385 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  35.21 
 
 		 385 aa  210  3e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  34.91 
 
 		 384 aa  207  1e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  34.32 
 
 		 389 aa  206  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  37.41 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  36.95 
 
 		 413 aa  200  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  40.88 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  40.88 
 
 		 419 aa  199  7e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  39.8 
 
 		 419 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  36.18 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  40.74 
 
 		 419 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  35.56 
 
 		 415 aa  196  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  36.7 
 
 		 417 aa  196  6e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  35.37 
 
 		 423 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  36.3 
 
 		 423 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  35.93 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  34.58 
 
 		 414 aa  181  1e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  30.49 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  33.87 
 
 		 415 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  35.69 
 
 		 419 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  34.68 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  30.47 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  33.56 
 
 		 435 aa  172  5.999999999999999e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  32.21 
 
 		 426 aa  168  1e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  33.33 
 
 		 417 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  32.31 
 
 		 457 aa  162  6e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  29.17 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  27.39 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  29.35 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  25.81 
 
 		 358 aa  123  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  24.63 
 
 		 362 aa  107  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2861  translation factor pelota  25.7 
 
 		 355 aa  57  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  29.19 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0863  translation factor pelota  27.27 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0626  putative translation factor pelota  25.64 
 
 		 351 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.991887  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0109  eRF1 domain-containing 1 protein  22.29 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000388933 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  21.86 
 
 		 355 aa  50.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  23.99 
 
 		 348 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  29.11 
 
 		 348 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1062  translation factor pelota  28.65 
 
 		 344 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0342  translation factor pelota  26.74 
 
 		 328 aa  46.6  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0139479  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2156  cell division protein pelota  26.34 
 
 		 341 aa  46.6  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0245621  hitchhiker  0.000505649 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  28.48 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42885  predicted protein  22.48 
 
 		 395 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  27.44 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2121  translation factor pelota  23.64 
 
 		 355 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.163385  normal  0.700321 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  25.88 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2924  translation factor pelota  23.91 
 
 		 356 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  23.53 
 
 		 347 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>