38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0409 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  100 
 
 		 415 aa  854    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  69.16 
 
 		 415 aa  616  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  60.96 
 
 		 414 aa  550  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  57.63 
 
 		 413 aa  492  9.999999999999999e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  51.58 
 
 		 423 aa  419  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 428 aa  411  1e-114  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  50.36 
 
 		 417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  49.76 
 
 		 423 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  47.34 
 
 		 419 aa  372  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  46.94 
 
 		 416 aa  362  8e-99  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  46.51 
 
 		 417 aa  362  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  43.81 
 
 		 406 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  45.56 
 
 		 417 aa  348  7e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  46.04 
 
 		 419 aa  347  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  43.41 
 
 		 419 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  45.12 
 
 		 419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  40.69 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  42 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  42.11 
 
 		 419 aa  299  8e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  42.11 
 
 		 419 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  31.81 
 
 		 426 aa  226  7e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  31.64 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  30.88 
 
 		 439 aa  202  7e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  29.21 
 
 		 442 aa  200  3e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  29.93 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  34.97 
 
 		 384 aa  188  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  34.31 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  34.09 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  33.44 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  27.9 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  34.49 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  33.55 
 
 		 338 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  31.69 
 
 		 357 aa  169  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  26.85 
 
 		 362 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  25.56 
 
 		 358 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1188  hypothetical protein  26.53 
 
 		 339 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00930  pelota, putative  28.65 
 
 		 415 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0299897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>