38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNC05580 on replicon NC_006685
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  100 
 
 		 439 aa  901    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  67.59 
 
 		 435 aa  615  1e-175  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  67.14 
 
 		 436 aa  596  1e-169  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  60.46 
 
 		 457 aa  541  9.999999999999999e-153  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  59.76 
 
 		 442 aa  530  1e-149  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  33.82 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  33.17 
 
 		 410 aa  234  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  31.62 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  31.26 
 
 		 419 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  32.22 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  31.07 
 
 		 413 aa  217  4e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  30.27 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  32.13 
 
 		 426 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  31.07 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  31.15 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  30.88 
 
 		 415 aa  202  8e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  29.59 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  30.22 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  30.48 
 
 		 416 aa  195  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  30.05 
 
 		 417 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  28.5 
 
 		 415 aa  193  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  30.24 
 
 		 428 aa  192  7e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  30.17 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  29.67 
 
 		 419 aa  189  5.999999999999999e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  31.2 
 
 		 419 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  29.48 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  30.95 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  29.17 
 
 		 389 aa  159  7e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  28.89 
 
 		 385 aa  158  1e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  30.74 
 
 		 385 aa  159  1e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  29.11 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  29.44 
 
 		 390 aa  156  6e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  27.43 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  29.01 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  25.19 
 
 		 362 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  25 
 
 		 358 aa  133  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  28.57 
 
 		 350 aa  47  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  27.03 
 
 		 298 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>