41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_80337 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  76.39 
 
 		 435 aa  701    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  100 
 
 		 436 aa  891    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  67.39 
 
 		 439 aa  596  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  64.88 
 
 		 457 aa  595  1e-169  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  60.86 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  33.98 
 
 		 410 aa  246  6.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  32.93 
 
 		 406 aa  239  6.999999999999999e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  31.02 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  30.86 
 
 		 413 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  32.31 
 
 		 426 aa  220  3.9999999999999997e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  30.52 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  29.93 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  29.08 
 
 		 423 aa  210  5e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  29.78 
 
 		 419 aa  209  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  29.72 
 
 		 423 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  30 
 
 		 428 aa  201  3e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  29.9 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  29.93 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  30.02 
 
 		 419 aa  193  5e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  29.06 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  30.36 
 
 		 419 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  28.91 
 
 		 417 aa  189  1e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  29.81 
 
 		 417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  28.13 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  30.18 
 
 		 419 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  30.18 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  29.72 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  29.21 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  25.95 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  28.33 
 
 		 338 aa  150  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  29.79 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  29.26 
 
 		 385 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  30.55 
 
 		 384 aa  142  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  28.62 
 
 		 389 aa  139  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  28.94 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  24.57 
 
 		 358 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  21.21 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1576  cell division protein pelota  26.51 
 
 		 350 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  25.1 
 
 		 355 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  24.4 
 
 		 347 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  28.03 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>