51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0803 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  100 
 
 
362 aa  710    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  69.38 
 
 
358 aa  486  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1077  peptide chain release factor 1  29.1 
 
 
406 aa  166  5e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2010  peptide chain release factor 1  30.5 
 
 
417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1509  peptide chain release factor 1  28.99 
 
 
428 aa  164  3e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.778286 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0170  peptide chain release factor 1  30 
 
 
416 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.579625  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1289  peptide chain release factor eRF/aRF, subunit 1  29.35 
 
 
417 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2836  peptide chain release factor 1  27.27 
 
 
423 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0210494 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  29.24 
 
 
410 aa  157  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1417  peptide chain release factor 1  29.77 
 
 
419 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0287  peptide chain release factor 1  27.09 
 
 
423 aa  154  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.213046 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80337  transcriptional release factor (ERF1)  25.95 
 
 
436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.565887  normal  0.0934364 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08853  ERF1_PODAN Eukaryotic peptide chain release factor subunit 1 (ERF1) (Eukaryotic release factor 1)Eukaryotic polypeptide releasing factor ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJX9]  25 
 
 
435 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3174  eRF1 domain 2 protein  30.47 
 
 
419 aa  150  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2212  peptide chain release factor 1  26.85 
 
 
417 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0359  peptide chain release factor 1  27.38 
 
 
413 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0270  peptide chain release factor 1  27.34 
 
 
423 aa  145  9e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1738  peptide chain release factor 1  26.78 
 
 
414 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0409  peptide chain release factor 1  26.85 
 
 
415 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1007  peptide chain release factor 1  26.67 
 
 
415 aa  142  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05580  translation release factor, putative  25.19 
 
 
439 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.690785  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0355  peptide chain release factor 1  27.27 
 
 
384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_50796  predicted protein  24.81 
 
 
457 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1818  peptide chain release factor 1  25.84 
 
 
385 aa  133  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0364142  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0303  peptide chain release factor 1  26.35 
 
 
385 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0986  peptide chain release factor 1  26.92 
 
 
389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.706075  hitchhiker  0.000607277 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49593  predicted protein  22.3 
 
 
442 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0646612 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  24.3 
 
 
419 aa  123  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0153  peptide chain release factor 1  25.84 
 
 
357 aa  122  7e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0264  peptide chain release factor 1  26.33 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  decreased coverage  0.00000000379955 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0437  peptide chain release factor 1  26.58 
 
 
419 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53256  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0882  peptide chain release factor 1  21.87 
 
 
426 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.558745 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0749  peptide chain release factor 1  24.63 
 
 
338 aa  105  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0557014  normal  0.0243779 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  21.79 
 
 
419 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  22.05 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  24.57 
 
 
419 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0937  putative translation factor pelota  37.61 
 
 
341 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0307408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5973  hypothetical protein  33.98 
 
 
218 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342038  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0539  cell division protein pelota  36 
 
 
342 aa  49.7  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.185665  normal  0.43653 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1962  hypothetical protein  34.55 
 
 
216 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0720  putative translation factor pelota  26.42 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1097  putative translation factor pelota  31.58 
 
 
348 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1084  putative translation factor pelota  26.98 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1591  cell division protein pelota  27.78 
 
 
348 aa  47.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2020  hypothetical protein  32.04 
 
 
224 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0862  translation factor pelota  25.2 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.592599  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2030  translation factor pelota  28.5 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.481161 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  25.38 
 
 
369 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1390  cell division protein pelota  28.33 
 
 
347 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0557084  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0438  putative translation factor pelota  34.69 
 
 
341 aa  43.5  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.750363  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1329  putative translation factor pelota  33.67 
 
 
341 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.520708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>