15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5973 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5973  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  422  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342038  normal  0.0834195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1962  hypothetical protein  70.05 
 
 		 216 aa  270  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16290  hypothetical protein  48.62 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4873  hypothetical protein  47.3 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3302  hypothetical protein  45.74 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000309887 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2459  hypothetical protein  41.7 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0114173  normal  0.0254112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2287  hypothetical protein  41.82 
 
 		 222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00162453  hitchhiker  0.00283491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2020  hypothetical protein  39.71 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2284  hypothetical protein  40.57 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.030938  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2749  hypothetical protein  39.46 
 
 		 293 aa  114  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0549681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2557  hypothetical protein  43 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0803  eRF1 domain 2 protein  33.98 
 
 		 362 aa  50.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3138  eRF1 domain 2 protein  34.23 
 
 		 358 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1602  hypothetical protein  34.12 
 
 		 302 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0714665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3257  hypothetical protein  28.57 
 
 		 298 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.471093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>